研究所目前下设机构有专家顾问委员会、调研中心、咨询策划部、信息中心、投融资部、人力资源部、项目合作办公室、《吉林政务商务指南》编辑部等职能部门。各个部门都具有自己清晰的部门职能,分别在所辖职能领域充分发挥着部门自身的职能,为推动研究所的不断发展贡献自己的力量。